A döntőre Bernben, a Wankdorfstadionban került sor és az ellenfél a csoportkörben korábban már legyőzött NSZK gárdája volt. A csapat szakvezetője, Sebes Gusztáv a döntő előtt némileg felforgatta a csatársort. Bár ennek oka máig nem tisztázódott, szerepet játszhaott benne, hogy az előző két mérkőzést kihagyó Puskás ismét játékra jelentkezett. Puskás beállítása is vitatéma a mai napig a szakemberek és a szurkolók körében, mivel többen is azon a véleményen vannak, hogy a legendás balösszekötő a mérkőzés előtt még nem volt teljesen egészséges.
A magyar csapat összeállítása a következő volt: Grosics-Buzánszky, Lóránt, Lantos-Bozsik, Zakariás-Czibor, Kocsis, Hidegkuti, Puskás, Tóth M. Az eredetileg balszélső Czibor átkerült a csapatból kiszorult Budai II helyére a jobbszélre, az ő helyén kezdett Tóth. A német szövetségi kapitány, Sepp Herberger hat helyen változtatta meg csapatát a 8-3-as meccshez képest. Ezt a lépést azóta is Herberger cselének emlegetik (arra hivatkozva, hogy azon a mérkőzésen "pihentette" a sztárjait, mert így elkerülték a brazil csapatot).
Bár a mérkőzés előtt esett az eső, a döntő mégis jól kezdődött a magyarok számára. Az esőtől felázot, mély talajon Puskás és Czibor korai góljával 8 perc alatt elhúztak 2–0-ra. A 19. percben mégis 2–2 állt az eredményjelzőn, Rahn és Morlock kiegyenlíteték a mérkőzést. Ez maradt az állás a szünet után is, egészen a 84. percig, amikor Rahn csípett el egy átadást, majd a labdát a csúszós talajon a kissé késve elvetődő Grosics mellett a kapu jobb oldalába rúgta, így lett 3–2. Néhány perccel később ugyan Puskás lőtt egy gólt, ám azt Ling játékvezető les miatt nem adta meg (ez a döntése is viták tárgya mindmáig). A végeredmény 3–2 lett a nyugatnémetek javára.
Futballtörténelmi érdekességek
Magyarország csapata lett az első olyan válogatott, amely két világbajnoki döntőt is elvesztett.
Az Aranycsapat 27 gólt szerzett a világbajnokság során, ami a mai napig rekord.
Szintén a világbajnoki döntők mai napig élő rekordjai közé tartozik, hogy az NSZK csapata kétgólos hátrányból fordította meg a mérkőzést.
A vereség után – a kommunista hatalomátvétel óta először – spontán tüntetés kezdődött Budapesten, a dühös szurkolók kirakatokat törtek be. A három napon keresztül tartó zavargásokat az ÁVH végül elfojtotta.[2][3]
A győzelem visszaadta a németeknek a második világháború miatt elvesztett önbecsülésüket. [4]
A berni csoda igaz története (németülDas Wunder von Bern – Die wahre Geschichte) címmel 2004-ben Németországban dokumentumfilm készült a mérkőzésről.[5] Ezután kiderült, hogy a nyugatnémet csapat több tagja is – akkor még legálisan – metamfetamint kapott a döntő előtt.[6]