Actinobacteria

A Wikipédiából, a szabad enciklopédiából
Ugrás a navigációhoz Ugrás a kereséshez
Infobox info icon.svg
Actinobacteria
Actinomyces israelii.jpg
Rendszertani besorolás
Hivatkozások
Wikifajok

A Wikifajok tartalmaz Actinobacteria témájú rendszertani információt.

Commons

A Wikimédia Commons tartalmaz Actinobacteria témájú kategóriát.

Az Actinobacteriumok a Gram-pozitív baktériumok családjába tartoznak. Lehetnek földi vagy vízi.[1] Nagy gazdasági jelentőségűek az emberek számára, mivel a mezőgazdaság és az erdők a talajrendszerekhez való hozzájárulásuktól függenek. A talajban elősegítik az elhalt organizmusok szerves anyagainak lebontását, így a molekulák újból felvehetők a növények által. Míg ezt a szerepet a gombák is betöltik, az Actinobacteriumok sokkal kisebbek és valószínűleg nem ugyanazt az ökológiai rést foglalják el. Ebben a szerepben a telepek gyakran kiterjedt micéliumot növesztenek, akárcsak egy gomba, és a védettség egyik fontos rendjének neve, az Actinomycetales (az aktinomicéták) azt tükrözi, hogy sokáig gombának hitték őket. Egyes talajaktinobaktériumok (például a Frankia ) szimbiotikusan élnek a növényekkel, amelyek gyökerei áthatolnak a talajon, nitrogénet kötve a növényekért cserébe a növény egyes szacharidjaihoz való hozzáférésért. Más fajok, például a Mycobacterium nemzetség számos tagja, fontos kórokozók .

Az Actinobacteriumok iránti talajszerepük iránti nagy érdeklődésen túl sok mindent meg kell még tanulni róluk. Bár jelenleg elsősorban talajbaktériumként értik őket, az édesvízben előfordulhat, hogy nagyobb mennyiségben fordul elő.[2] Az aktinobaktériumok az egyik domináns bakteriális phyla, és az egyik legnagyobb baktérium nemzetséget, a Streptomyces-t tartalmazza.[3] A Streptomyces és más aktinobaktériumok a talaj biológiai pufferelésének fő hozzájárulói.[4] Számos antibiotikum is ezek forrása.

Noha a legnagyobb és legösszetettebb baktériumsejtek egy része az Actinobacteriumokhoz tartozik, a tengeri Actinomarinales csoportról azt írták, hogy a legkisebb szabadon élő prokarióta sejtekkel rendelkezik.[5]

Egyes szibériai vagy antarktiszi aktinobaktériumok állítólag a Föld legöregebb élő organizmusai, amelyek félmillió évvel ezelőtt örökfagyba fagytak.[6][7] Az élet tüneteit a CO</br> CO felszabadulás a 640 kya vagy annál fiatalabb permafrost mintákból.[8]

A legtöbb orvosi vagy gazdasági jelentőségű Actinobacterium az Actinobacteridae alosztályba tartozik, és az Actinomycetales rendjébe tartozik. Míg ezek közül sok emberben betegséget okoz, a Streptomyces az antibiotikumok forrásaként figyelemre méltó. 

Az Actinomycetalesben nem szereplő Actinobacteriumok közül a Gardnerella az egyik leginkább kutatott. A Gardnerella osztályozása ellentmondásos, és a MeSH mind Gram-pozitív, mind Gram-negatív szervezetként katalogizálja.

Az aktinobaktériumokat, különösen a Streptomyces spp. Számos bioaktív metabolit termelőjeként ismerik el, amelyek az ember számára hasznosak az orvostudományban, mint például antibakteriális szerek,[9] gombaellenes szerek,[10] vírusellenes szerek, antitrombotikus szerek, immunmodifikátorok, daganatellenes szerek és enzimgátlók; és a mezőgazdaságban, ideértve a rovarölő, gyomirtó, gombaölő és a növények és állatok növekedését elősegítő anyagokat.[11][12] Az orvostudományban fontos aktinobaktériumokból származó antibiotikumok közé tartoznak az aminoglikozidok, antraciklinek, klóramfenikol, makrolidok, tetraciklinek stb.

Az aktinobaktériumok DNS-ében magas guanin- és citozintartalom található.[13] Az Actinobacteriumok G + C tartalma akár 70% is lehet, bár egyesek alacsony G + C tartalommal bírhatnak.[14]

A glutamin-szintetáz szekvencia elemzését javasolták az Actinobacteriumok filogenetikai elemzéséhez.[15]

Törzsfejlődés[szerkesztés]

A filogenitás a 'The All-Species Living Tree' Project 16S rRNS-alapú LTP 123. kiadásán alapul.

Rendszertan[szerkesztés]

Megjegyzések:</br> ♠ Az Országos Biotechnológiai Információs Központban (NCBI) található törzsek, amelyek nem szerepelnek a Nómenklatúrában álló prokarióta nevek listájában (LSPN)

  • Species "Cathayosporangium alboflavum" ♠ Runmao et al. 1995
  • Species "Candidatus Planktophila limnetica" Jezbera et al. 2009
  • Species "Tonsillophilus suis" ♠ Azuma and Bak 1980
  • Class Rubrobacteria Suzuki 2013 (Rubrobacteridae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
    • Order Rubrobacterales Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
      • Family Rubrobacteraceae Rainey et al. 1997
  • Class Thermoleophilia Suzuki & Whitman 2013 (Thermoleophilidae)
    • Order Gaiellales Albuquerque et al. 2012
      • Family Gaiellaceae Albuquerque et al. 2012
    • Order Thermoleophilales Reddy & Garcia-Pichel 2009
      • Family Thermoleophilaceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
    • Order Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009
      • Family Conexibacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
      • Family Patulibacteraceae Takahashi et al. 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
      • Family Solirubrobacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi et al. 2009
  • Class Coriobacteriia Konig 2013 emend. Gupta et al. 2013 (Coriobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
    • Order Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
      • Family Atopobiaceae Gupta et al. 2013
      • Family Coriobacteriaceae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
    • Order Eggerthellales Gupta et al. 2013
      • Family Eggerthellaceae Gupta et al. 2013
  • Class Acidimicrobiia Norris 2013 (Acidimicrobidae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
    • Order Acidimicrobiales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009 [Acidimicrobineae Garrity, Bell & Lilburn 2003]
      • Family Acidimicrobiaceae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
      • Family Iamiaceae Kurahashi et al. 2009
      • Family "Microthrixaceae" Joseph et al. 2003
  • Class Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013 (Nitriliruptoridae Kurahashi et al. 2010)
    • Order Egibacterales Zhang et al. 2016
      • Family Egibacteraceae Zhang et al. 2016
    • Order Egicoccales Zhang et al. 2015
      • Family Egicoccaceae Zhang et al. 2015
    • Order Euzebyales Kurahashi et al. 2010
      • Family Euzebyaceae Kurahashi et al. 2010
    • Order Nitriliruptorales Sorokin et al. 2009
      • Family Nitriliruptoraceae Sorokin et al. 2009
  • Class Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 (Actinobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
    • Species ?"Boyliae praeputiale" ♠ Yates et al. 2002
    • Order ?"Actinomarinales" Ghai et al. 2013 ["Actinomarinidae" Ghai et al. 2013]
      • Family "Actinomarinaceae" Ghai et al. 2013
    • Order Acidothermales Sen et al. 2014
      • Family Acidothermaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi et al. 2009
    • Order "Catenulisporales" Donadio et al. 2012 (Catenulisporineae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009)
      • Family Actinospicaceae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
      • Family Catenulisporaceae Busti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
    • Order "Streptomycetales" Kampfer 2012 (Streptomycetineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
      • Family Streptomycetaceae Waksman & Henrici 1943 emend. Zhi et al. 2009
    • Order Geodermatophilales Sen et al. 2014
      • Family Geodermatophilaceae Normand 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
    • Order Frankiales Sen et al. 2014 (Frankineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
      • Family Motilibacteraceae Lee 2013
      • Family Cryptosporangiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
      • Family Frankiaceae Becking 1970 emend. Zhi et al. 2009
      • Family Sporichthyaceae Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
    • Order Nakamurellales Sen et al. 2014
      • Family Nakamurellaceae Tao et al. 2004 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009 [Microsphaeraceae Rainey et al. 1997]
    • Order "Kineosporiales" Kampfer 2012 (Kineosporineae Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
      • Family Kineosporiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
    • Order Micrococcales Prevot 1940 [Arthrobacteria; Micrococcineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Yassin et al. 2011; incl. Flavobacterium oceanosedimentum; Bifidobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009; Actinomycetales Buchanan 1917 emend. Zhi et al. 2009]
      • Family Intrasporangiaceae
      • Family Microbacteriaceae
      • Family Cellulomonadceae
      • Family Promicromonosporaceae
      • Family Sanguibacteraceae
      • Family Rarobacteraceae
      • Family Jonesiaceae
      • Family Bogoriellaceae
      • Family Beutenbergiaceae
      • Family Ruaniaceae
      • Family Actinomycetaceae
      • Family Demequinaceae
      • Family Dermabacteraceae
      • Family Brevibacteriaceae
      • Family Micrococcaceae {incl. Bifidobacteriaceae]])
    • Order "Propionibacteriales" Patrick & McDowell 2012 (Propionibacterineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
      • Family Nocardioidaceae
      • Family Propionibacteriaceae
    • Order "Streptosporangiales" Goodfellow 2012 (Streptosporangineae Ward-Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
      • Family Streptosporangiaceae
      • Family Nocardiopsaceae
      • Family Thermomonosporaceae
    • Order "Jiangellales" Tang et al. 2012 (Jiangellineae Tang et al. 2011)
      • Family Jiangellaceae Tang et al. 2011
    • Order "Glycomycetales" Labeda 2012 (Glycomycetineae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
      • Family Glycomycetaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
    • Order "Micromonosporales" Genilloud 2012 (Micromonosporineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009; Actinoplanales]
      • Family Micromonosporaceae
    • Order "Pseudonocardiales" Labeda & Goodfellow 2012 (Pseudonocardineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Labeda et al. 2011)
      • Family Pseudonocardiaceae
    • Order "Corynebacteriales" Goodfellow & Jones 2012 (Corynebacterineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009<meta />; Mycobacteria)
      • Family Segniliparaceae
      • Family Nocardiaceae [Gordoniaceae; Williamsiaceae]
      • Family Dietziaceae
      • Family Corynebacteriaceae
      • Family Tsukamurellaceae
      • Family Mycobacteriaceae

Jegyzetek[szerkesztés]

  1. (2008. január 1.) „Evidence excluding the root of the tree of life from the actinobacteria”. Mol. Biol. Evol. 25 (1), 1–4. o. DOI:10.1093/molbev/msm249. PMID 18003601.  
  2. (2011) „Metagenomics of the water column in the pristine upper course of the Amazon river”. PLOS ONE 6 (8), e23785. o. DOI:10.1371/journal.pone.0023785. PMID 21915244.  
  3. C.Michael Hogan.. 2010. Bacteria. Encyclopedia of Earth. eds. Sidney Draggan and C.J.Cleveland, National Council for Science and the Environment, Washington DC Archiválva 2011. május 11-i dátummal a Wayback Machine-ben.
  4. Ningthoujam (2009. november 1.). „Antagonistic activities of local actinomycete isolates against rice fungal pathogens”. African Journal of Microbiology Research 3 (11), 737–742. o.  
  5. (2013) „Metagenomics uncovers a new group of low GC and ultra-small marine Actinobacteria”. Scientific Reports 3, 2471. o. DOI:10.1038/srep02471. PMID 23959135.  
  6. Sussman: Oldest Plants, The Guardian, 2 May 2010
  7. It's Okay to be Smart • the oldest living thing in the world: These. [2018. július 13-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2018. július 13.)
  8. Johnson (2007). „Ancient bacteria show evidence of DNA repair”. Proceedings of the National Academy of Sciences 104 (36), 14401–14405. o. DOI:10.1073/pnas.0706787104. PMID 17728401.  
  9. Mahajan (2012). „Antibacterial agents from actinomycetes - a review”. Frontiers in Bioscience 4, 240–53. o. DOI:10.2741/e373.  
  10. Gupte (2002). „Antifungal Antibiotics”. Appl. Microbiol. Biotechnol. 58 (1), 46–57. o. DOI:10.1007/s002530100822. PMID 11831475.  
  11. Bressan (2003). „Biological control of maize seed pathogenic fungi by use of actinomycetes”. Biocontrol 48 (2), 233–240. o. DOI:10.1023/a:1022673226324.  
  12. Atta (2009). „Antimycin-A Antibiotic Biosynthesis Produced by Streptomyces Sp. AZ-AR-262: Taxonomy, Fermentation, Purification and Biological Activities”. Austral. J. Basic and Appl. Sci. 3, 126–135. o.  
  13. Ventura (2007. szeptember 5.). „Genomics of Actinobacteria: Tracing the Evolutionary History of an Ancient Phylum”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 71 (3), 495–548. o. DOI:10.1128/MMBR.00005-07. PMID 17804669.  
  14. (2012) „Breaking a paradigm:cosmopolitan and abundant freshwater actinobacteria are low GC”. Environmental Microbiology Reports 4 (1), 29–35. o. DOI:10.1111/j.1758-2229.2011.00274.x. PMID 23757226.  
  15. (2009) „Glutamine synthetase sequence evolution in the mycobacteria and their use as molecular markers for Actinobacteria speciation”. BMC Evol. Biol. 9, 48. o. DOI:10.1186/1471-2148-9-48. PMID 19245690.  

További információk[szerkesztés]

Fordítás[szerkesztés]

Ez a szócikk részben vagy egészben az Actinobacteria című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.