SARS-CoV-2 delta variáns

A Wikipédiából, a szabad enciklopédiából
Ugrás a navigációhoz Ugrás a kereséshez
Országok, amelyekben 2021. július 9-éig megerősítették a delta variáns eseteit (GISAID)

Jelmagyarázat:
  5000+ megerősített eset
  1000–4999 megerősített eset
  100–999 megerősített eset
  10–99 megerősített eset
  2–9 megerősített eset
  1 megerősített eset
  Nincs vagy adat nem elérhető

A SARS-CoV-2 delta variáns, más néven B.1.617.2 törzs a SARS-CoV-2 B.1.617 törzs variánsa, ez annak a vírusnak a mutációja, ami a COVID-19 járványért felelős.[1] Először Indiában mutatták ki 2020 végén.[2][3] A World Health Organization (WHO) delta variánsnak nevezte el 2021. május 31-én.[4]

Osztályozás[szerkesztés]

A delta variáns mutációi a SARS-CoV-2 tüskefehérjét kódoló génjében vannak,[5] ami a D614G, T478K, P681R és L452R szubsztitúciókat okozza.[6][7] A Nextstrain filogenetikai osztályozási rendszere szerint 21A kládként azonosítják.[8]

2021. május végén a WHO a delta címkét a B.1.617.2 nemzetséghez rendelte, miután új szabályokat vezetett be a görög betűk használatáról az aggasztó és az érdekes változatokra.[4]

A B.1.617. egyéb alágai[szerkesztés]

A B.1.617 törzs három alágát osztályozták eddig.

A B.1.617.1-et 2021 áprilisában a vizsgálat alatt álló változatnak nevezte ki a Public Health England. Később, 2021 áprilisában a B.1.617.2 és B.1.617.3 változatot jelölték ki a vizsgált variánsoknak. Míg a B.1.617.3-ban és B.1.617.1-ben található L452R és E484Q mutációk közösek, addig a B.1.617.2-ből hiányzik az E484Q mutáció. A B.1.617.2 T478K mutációval rendelkezik, a B.1.617.1-ben és a B.1.617.3-ban ez nem található meg.[9][10] Ezzel egy időben az ECDC kiadott egy rövid ismertetést, amely a B.1.617 mindhárom alágát VOI-ként tartotta fenn, becslései szerint „az ezen B.1.617 törzshöz kapcsolódó kockázatok jobb megértése szükséges, mielőtt a jelenlegi intézkedések bármilyen módosítását fontolóra lehetne venni”.[11]

Gén Nukleotid Aminosav
ORF1b P314L
P1000L
Tüske G142D
T19R
R158G
L452R
T478K
D614G
P681R
D950N
E156del
F157del
M I82T
N D63G
R203M
D377Y
orf3a S26L
orf7a V82A
T120I
Források: CDC[12] Covariants.org[13]

A delta/B.1.617.2 genomnak 13 mutációja van (egyes források szerint 15 vagy 17, attól függően, hogy a gyakoribb mutációkat is beleszámolják-e), amelyek megváltoztatják az általa kódolt fehérjék aminosav-szekvenciáit.[3] Négy közülük, amelyek mindegyike szerepel a vírus tüskefehérje kódjában, különös aggodalomra ad okot:

  • D614G. A 614-es pozícióban levő aszparaginsav-glicin szubsztitúció, más erősen átvihető változatokkal azonos, például az alfával, a bétával és a gammával közös.[14]
  • T478K.[6] A 478. pozícióban lévő csere treonin-lizin szubsztitúció.[15]
  • L452R. A 452. pozícióban levő leucin-arginin szubsztitúció a tüskefehérje erősebb affinitását biztosítja az ACE2 receptorhoz[16] és az immunrendszer csökkent felismerési képességét.[7][17] Ezek a mutációk külön-külön, egyenként véve nem egyediek a variánsra nézvést, azonban egyidejű előfordulásuk már igen.[18]
  • P681R. A 681. pozícióban lévő prolin-arginin szubsztitúció, amely William A. Haseltine szerint növelheti a variáns sejtszintű fertőzőképességét, „megkönnyítve az S prekurzor fehérje hasítását az aktív S1/S2 konfigurációig”.[19]

Az E484Q mutáció nincs jelen a B.1.617.2 törzs genomjában.[19][20]

Kezelés[szerkesztés]

A SARS-CoV-2 delta variáns által fertőzöttek kezelése megegyezik a COVID-19 fertőzésével.

Hivatkozások[szerkesztés]

  1. Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK”, www.gov.uk, 2021. április 15. (Hozzáférés ideje: 2021. április 20.) 
  2. Tracking of Variants. gisaid.org. GISAID, 2021. április 26. (Hozzáférés: 2021. július 2.)
  3. a b Expert reaction to cases of variant B.1.617 (the 'Indian variant') being investigated in the UK. Science Media Centre. (Hozzáférés: 2021. április 20.)
  4. a b Covid: WHO renames UK and other variants with Greek letters”, BBC News, 2021. május 31. (Hozzáférés ideje: 2021. június 8.) 
  5. Shang (2020. november 30.). „Cell entry mechanisms of SARS-CoV-2”. Proceedings of the National Academy of Sciences 117 (21), 11727–11734. o. DOI:10.1073/pnas.2003138117. PMID 32376634.  
  6. a b SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. (Hozzáférés: 2021. június 15.)
  7. a b Starr (2021. április 1.). „Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016”. Cell Reports Medicine 2 (4), 100255. o. DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100255. PMID 33842902.  
  8. Genomic epidemiology of novel coronavirus - Global subsampling (Filtered to B.1.617). nextstrain.org. (Hozzáférés: 2021. május 5.)
  9. SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. Centers for Disease Control and Prevention, 2021. május 12. (Hozzáférés: 2021. május 16.)
  10. Di Giacomo (2021). „Preliminary report on severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Spike mutation T478K”. Journal of Medical Virology. DOI:10.1002/jmv.27062. PMID 33951211.  
  11. Threat Assessment Brief: Emergence of SARS-CoV-2 B.1.617 variants in India and situation in the EU/EEA. European Centre for Disease Prevention and Control, 2021. május 11. (Hozzáférés: 2021. május 17.)
  12. SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. cdc.gov. Centers for Disease Control and Prevention, 2021. június 15. (Hozzáférés: 2021. június 18.)
  13. Dedicated 21A.S.478K Nextstrain build. covariants.org, 2021. június 15. (Hozzáférés: 2021. június 19.)
  14. SARS-CoV-2 variants of concern as of 24 May 2021. European Centre for Disease Prevention and Control. (Hozzáférés: 2021. május 29.)
  15. Greenwood. „SARS-CoV-2 mutation T478K spreading at alarming speed in Mexico”, Medical News, 2021. március 30. (Hozzáférés ideje: 2021. június 15.) 
  16. South (2020. május 1.). „COVID-19, ACE2, and the cardiovascular consequences”. American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology 318 (5), H1084–H1090. o. DOI:10.1152/ajpheart.00217.2020.  
  17. Zhang (2021. április 6.). „Emergence of a Novel SARS-CoV-2 Variant in Southern California”. JAMA 325 (13), 1324–1326. o. DOI:10.1001/jama.2021.1612. PMID 33571356.  
  18. Koshy. „Coronavirus | Indian 'double mutant' strain named B.1.617”, The Hindu, 2021. április 8. (Hozzáférés ideje: 2021. április 19.) (angol nyelvű) „Though these mutations have individually been found in several other coronavirus variants, the presence of both these mutations together have been first found in some coronavirus genomes from India. 
  19. a b Haseltine. „An Indian SARS-CoV-2 Variant Lands In California. More Danger Ahead?”, Forbes (Hozzáférés ideje: 2021. április 20.) (angol nyelvű) 
  20. Hoffmann (2021. június 1.). „SARS-CoV-2 variant B.1.617 is resistant to Bamlanivimab and evades antibodies induced by infection and vaccination”. Cell Reports, 109415. o. DOI:10.1016/j.celrep.2021.109415. ISSN 2211-1247. „Collectively, our study reveals that antibody evasion of B.1.617 may contribute to the rapid spread of this variant... ...The RBD of the B.1.617 S protein harbors two mutations associated with (L452R) or suspected (E484Q) of antibody evasion... ...Moreover, E484K present the B.1.351 and P.1 variants confers antibody resistance (Li et al., 2021) and one could speculate that exchange E484Q might have a similar effect. 

Külső linkek[szerkesztés]