Discoba
 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
| Rendszertani besorolás | ||||||
| ||||||
| Hivatkozások | ||||||
A Discoba a Diphoda csoportja. Neve a Discicristata és Jakobida csoportok neveinek összevonásából ered.[1] Ezenkívül a csoport tagja a Tsukubamonada és a Heterolobosea is. A Discoba tagja továbbá a Percolozoa, melynek egyetlen ismert fertőző faja az amőbás agyhártyagyulladást okozó Naegleria fowleri.
A Discoba testvércsoportja egyes feltételezések szerint az Ophirinina.[2]
Jellemzői
[szerkesztés]A Discoba sok gént tartalmazó mitokondriumai általában lemezes cristákkal rendelkeznek. A Pleurostomum flabellatum cristái redukálódtak, így feltehetően redukálódott vagy megszűnt képessége a sejtlégzésre. A mitokondriális genomok hosszúak, például a P. flabellatumé 57 829 bázispár.[3]
Heterolobosea
[szerkesztés]Egy Heterolobosea-faj, az Acrasis kona mtDNS-ében a többi Heterolobosea-faj génjeinek 40%-a nincs jelen, és benne többszörös nyitott leolvasási keretek találhatók.[4] Ez a DNS körkörös, GC-tartalma alacsony (16,7%).[4] Az A. kona mitokondriuma 26 ismert fehérjekódoló, 11 tRNS-gén és 10 feltételezett gén található.[4] Ez a faj továbbá képes RNS C→U módosítására is.[4] Az A. kona genomelemzése feltehetően új filogenetikai életfát tehet lehetővé, ahol az Excavata az Amorphea, a Stramenopila, Alveolata, Rhizaria és Plantae csoportokat tartalmazó Neozoa testvércsoportja.[5]
A Naegleria fowleri és a Naegleria gruberi mtDNS-ei tartalmazzák a legtöbb gént a Jakobidán kívül 42 jelzett és 4 feltételezett génnel,[4]
Egyes Heterolobosea-fajok, például a Monopylocystis- és a Pseudoharpagon-fajok sós vízben, például tengervízben élnek.[6]
Az Euplaesiobystra salpumilio esetén a sók aktív transzportja 75-100 PSU[* 1] koncentrációjú oldatban a sejtbe, 150 PSU koncentrációjúban a sejtből történik.[7] Ezenkívül legalább 4 Heterolobosea-klád nagyon vagy kizárólagosan halofil.[7]
Jakobida
[szerkesztés]
A Jakobida szabadon élő heterotróf ostoros eukarióták rendje. Ezek kicsik, és aerob és anaerob környezetekben is élnek.[8][9][10] A monofiletikusnak tekintett rendben jelenleg 20 ismert faj van, és 1993-ban ismerték el rendszertani csoportként.[8][10][11]
Egy 2009-es tanulmány szerint mivel sok tenyésztetlen protisztaágat kevés, akár egy szekvencia is képviselhet, ezek igen sokrétű „ritka bioszférát” alkotnak.[12]
A Jakobida-fajok mtDNS-e általában nagyon sok gént tartalmaz, például a legtöbb fehérjét és tRNS-t kódoló gént tartalmazó mtDNS az Andalucia godoyié 66 fehérjekódoló és 22 tRNS-génnel.[4]
Discicristata
[szerkesztés]A Discicristata a Discoba egyik csoportja, tagjai az ostoros moszatok (Euglenozoa) és a Percolozoa.[13] Nincs Sun fehérjéjük vagy Tpr/Mlp-homológjuk.[14]
Tsukubea
[szerkesztés]A Tsukubea osztály egyetlen ismert nemzetsége (2023) a Tsukubamonas, ennek egyetlen ismert faja a T. globosa.[15][16] Ennek mtDNS-e 48 643 bázispárból áll.[17]
Fontosságuk
[szerkesztés]A Discoba-fajok mitokondriális genomjainak megismerése fontos a mtDNS korai fejlődésének megértéséhez, mivel mtDNS-ük nagyon sok gént tartalmaz.[3]
Megjegyzések
[szerkesztés]- ↑ Practical Salinity Unit: 1 PSU = 1 g/kg
Hivatkozások
[szerkesztés]- ↑ Rodríguez-Ezpeleta, Naiara (2007). „Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans”. Current Biology 17 (16), 1420–1425. o. DOI:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961. (Hozzáférés: 2023. október 31.)
- ↑ Luis Javier Galindo, Kristina Prokina, Guifré Torruella, Purificación López-García, David Moreira (2023. április). „Maturases and Group II Introns in the Mitochondrial Genomes of the Deepest Jakobid Branch”. Genome Biol Evol.. PMID 37029959. PMC 10139444. (Hozzáférés: 2023. október 31.)
- ↑ a b Khaoula Ettahi, Duckhyun Lhee, Ji Yeon Sung, Alastair G B Simpson, Jong Soo Park, Hwan Su Yoon (2021. február). „Evolutionary History of Mitochondrial Genomes in Discoba, Including the Extreme Halophile Pleurostomum flabellatum (Heterolobosea)”. DOI:10.1093/gbe/evaa241. PMID 33185659. PMC 7900873. (Hozzáférés: 2023. október 31.)
- ↑ a b c d e f Cheng-Jie Fu, Sanea Sheikh, Wei Miao, Siv G. E. Andersson, Sandra L. Baldauf (2014. szeptember). „Missing Genes, Multiple ORFs, and C-to-U Type RNA Editing in Acrasis kona (Heterolobosea, Excavata) Mitochondrial DNA”. Genome Biol. Evol. 6 (9), 2240–2257. o. PMID 25146648. PMC 4202320. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ Ding He, Omar Fiz Palacios, Cheng-Jie Fu, Johanna Fehling, Chun-Chieh Tsai, Sandra L. Baldauf (2014. február 17.). „An Alternative Root for the Eukaryote Tree of Life”. Current Biology 24 (4), 465–470. o. DOI:10.1016/j.cub.2014.01.036.
- ↑ Tomás Pánek, Eliška Plačková, Ivan Čepička (2014. július 1.). „Survey on diversity of marine/saline anaerobic Heterolobosea (Excavata: Discoba) with description of seven new species”. International Journal of Systematic and Evolutionary Biology 64 (Pt 7). DOI:10.1099/ijs.0.063487-0. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ a b Hyeon Been Lee, Dong Hyuk Jeong, Jong Soo Park (2022. augusztus 5.). „Accumulation patterns of intracellular salts in a new halophilic amoeboflagellate, Euplaesiobystra salpumilio sp. nov., (Heterolobosea; Discoba) under hypersaline conditions”. Front Microbiol. 13. PMID 35992684. PMC 9389213. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ a b (1993) „The Jakobid flagellates: structural features of Jakoba, Reclinomonas, and Histonia and implications for the early diversification of eukaryotes”. Journal of Eukaryotic Microbiology 40 (5), 627–636. o. DOI:10.1111/j.1550-7408.1993.tb06120.x.
- ↑ (2016) „Moramonas marocensis gen. nov., sp. nov.: a jakobid flagellate isolated from desert soil with a bacteria-like, but bloated mitochondrial genome”. Open Biology 6 (2), 150239. o. DOI:10.1098/rsob.150239. PMID 26887409. PMC 4772810.
- ↑ a b (2013) „Strikingly Bacteria-Like and Gene-Rich Mitochondrial Genomes throughout Jakobid Protists”. Genome Biology and Evolution 5 (2), 418–438. o. DOI:10.1093/gbe/evt008. PMID 23335123. PMC 3590771.
- ↑ Jakobids, Handbook of the Protists. Springer, Cham, 973–1003. o.. DOI: 10.1007/978-3-319-28149-0_6 (2017). ISBN 978-3-319-28147-6
- ↑ Tomáš Pánek, Petr Táborský, Maria G. Pachiadaki, Miluše Hroudová, Čestmír Vlček, Virginia P. Edgcomb, Ivan Čepička (2015. november 18.). „Combined Culture-Based and Culture-Independent Approaches Provide Insights into Diversity of Jakobids, an Extremely Plesiomorphic Eukaryotic Lineage”. Front Microbiol. 6, 1288. o. DOI:10.3389/fmicb.2015.01288. PMID 26635756. PMC 4649034. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ T. Cavalier-Smith (2003. november). „The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 53 (Pt 6), 1741–58. o. DOI:10.1099/ijs.0.02548-0. PMID 14657102.
- ↑ Damien P. Devos, Ralph Graf, Mark C. Field (2014. június). „Evolution of the nucleus”. Current Opinion in Cell Biology. DOI:10.1016/j.ceb.2014.01.004. PMID 24508984. PMC 4071446. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ Yabuki, Akinori (2011. július 1.). „Tsukubamonas globosa n. gen., n. sp., A Novel Excavate Flagellate Possibly Holding a Key for the Early Evolution in "Discoba": Tsukubamonas globosa n. g., n. sp.” (angol nyelven). Journal of Eukaryotic Microbiology 58 (4), 319–331. o. DOI:10.1111/j.1550-7408.2011.00552.x. PMID 21569159.
- ↑ Cavalier-Smith, Thomas (2013). „Early evolution of eukaryote feeding modes, cell structural diversity, and classification of the protozoan phyla Loukozoa, Sulcozoa, and Choanozoa”. European Journal of Protistology 49 (2), 115–178. o. DOI:10.1016/j.ejop.2012.06.001. ISSN 0932-4739. PMID 23085100.
- ↑ Ryoma Kalikawa et al. (2014. február). „Gene Content Evolution in Discobid Mitochondria Deduced from the Phylogenetic Position and Complete Mitochondrial Genome of Tsukubamonas globosa”. Genome Biol Evol. 6 (2), 306–315. o. DOI:10.1093/gbe/evu015. PMID 24448982. PMC 3942025. (Hozzáférés: 2023. november 1.)