2010-ben alapította meg a klubot Goran Pandev, amely ifjúsági akadémiaként kezdte működését.[3][4] 2014-ben alapították meg a felnőttcsapatot, amely a körzeti amatőr bajnokságban indult.[4] A következő évben minden osztályt megnyertek és a 2017–2018-as szezont már az élvonalban kezdték meg.[5] 2018 februárjában a Kukus Stadionba költöztek, miután a Belaszica csapata megemelte a bérleti díjat a stadionjuk használatára.[6][7] A 2018–2019-es szezonban a Makedonija csapata ellen megnyerték a kupát.[8] Ezáltal elindulhatott a klub történelme során először az Európa-liga1. selejtezőkörében, ahol a bosnyák Zrinjski Mostar ellen mind a két mérkőzésen kikaptak.[9][10] 2020. november 7-én léptek először pályára a saját pályájukon a Pandev Sportcentrumban.[11][12][13] 2023 májusában Pandev a klub részvényeinek 90 százalékát eladta az olasz Brera Holdingnak.[14]
Toni Atanaszov
Pancse Sztojanov (2015–2018)
Zrinjski Mostar
Lechia Gdańsk
