„Discoba” változatai közötti eltérés
| [ellenőrzött változat] | [ellenőrzött változat] |
Tartalom törölve Tartalom hozzáadva
Nincs szerkesztési összefoglaló |
bőv. |
||
| 10. sor: | 10. sor: | ||
==Jellemzői== |
==Jellemzői== |
||
A ''Discoba'' mitokondriumai általában lemezes [[crista|cristákkal]] rendelkeznek. A ''Pleurostomum flabellatum'' cristái redukálódtak, így feltehetően redukálódott vagy megszűnt képessége a [[sejtlégzés]]re. A mitokondriális genomok hosszúak, például a ''P. flabellatum''é {{szám|57829}} bázispár.<ref name="Ettahi 2021">{{cite journal|author=Khaoula Ettahi, Duckhyun Lhee, Ji Yeon Sung, Alastair G B Simpson, Jong Soo Park, Hwan Su Yoon|title=Evolutionary History of Mitochondrial Genomes in Discoba, Including the Extreme Halophile Pleurostomum flabellatum (Heterolobosea)|year=2021|month=február|doi=10.1093/gbe/evaa241|pmid=33185659|pmc=7900873|accessdate=2023-10-31}}</ref> |
A ''Discoba'' mitokondriumai általában lemezes [[crista|cristákkal]] rendelkeznek. A ''Pleurostomum flabellatum'' cristái redukálódtak, így feltehetően redukálódott vagy megszűnt képessége a [[sejtlégzés]]re. A mitokondriális genomok hosszúak, például a ''P. flabellatum''é {{szám|57829}} bázispár.<ref name="Ettahi 2021">{{cite journal|author=Khaoula Ettahi, Duckhyun Lhee, Ji Yeon Sung, Alastair G B Simpson, Jong Soo Park, Hwan Su Yoon|title=Evolutionary History of Mitochondrial Genomes in Discoba, Including the Extreme Halophile Pleurostomum flabellatum (Heterolobosea)|year=2021|month=február|doi=10.1093/gbe/evaa241|pmid=33185659|pmc=7900873|accessdate=2023-10-31}}</ref> |
||
===''Heterolobosea''=== |
|||
| ⚫ | Egy ''Heterolobosea''-faj, az ''Acrasis kona'' mtDNS-éből a ''Heterolobosea'' többi fajára jellemző gének 40%-a hiányzik, ezenkívül e DNS-ben többszörös [[nyitott leolvasási keret]]ek találhatók.<ref name="Fu 2014">{{cite journal|author=Cheng-Jie Fu, Sanea Sheikh, Wei Miao, Siv G. E. Andersson, Sandra L. Baldauf|title=Missing Genes, Multiple ORFs, and C-to-U Type RNA Editing in Acrasis kona (Heterolobosea, Excavata) Mitochondrial DNA|year=2014|month=szeptember|journal=Genome Biol. Evol.|pmid=25146648|pmc=4202320|volume=6|issue=9|pp=2240–2257|accessdate=2023-11-01}}</ref> Ez a DNS körkörös, GC-tartalma alacsony (16,7%).<ref name="Fu 2014"/> Az ''Acrasis konában'' pedig 26 ismert fehérjekódoló, 11 tRNS-gén és 10 feltételezett gén található.<ref name="Fu 2014"/> Ez a faj továbbá képes RNS C→U módosítására is.<ref name="Fu 2014"/> |
||
| ⚫ | A ''Naegleria fowleri'' és a ''[[Naegleria gruberi]]'' mtDNS-ei tartalmazzák a legtöbb gént a ''Jakobidán'' kívül 42 jelzett és 4 [[feltételezett gén]]nel,<ref name="Fu 2014"/> a legtöbb fehérjét és tRNS-t kódoló gént tartalmazó mtDNS pedig az ''[[Andalucia godoyi]]''é 66 génnel és 22 tRNS-génnel.<ref name="Fu 2014"/> |
||
| ⚫ | Egy '' |
||
| ⚫ | A ''Naegleria fowleri'' és a ''[[Naegleria gruberi]]'' mtDNS-ei tartalmazzák a legtöbb gént a ''Jakobidán'' kívül 42 |
||
Egyes ''Heterolobosea''-fajok, például a ''Monopylocystis''- és a ''Pseudoharpagon''-fajok sós vízben, például tengervízben élnek.<ref name="Pánek 2014">{{cite journal|author=Tomás Pánek, Eliška Plačková, Ivan Čepička|title=Survey on diversity of marine/saline anaerobic Heterolobosea (Excavata: Discoba) with description of seven new species|date=2014-07-01|accessdate=2023-11-01|doi=10.1099/ijs.0.063487-0|journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Biology|url=https://www.microbiologyresearch.org/docserver/fulltext/ijsem/64/7/2280_ijs063487.pdf|volume=64|issue=Pt 7}}</ref> |
Egyes ''Heterolobosea''-fajok, például a ''Monopylocystis''- és a ''Pseudoharpagon''-fajok sós vízben, például tengervízben élnek.<ref name="Pánek 2014">{{cite journal|author=Tomás Pánek, Eliška Plačková, Ivan Čepička|title=Survey on diversity of marine/saline anaerobic Heterolobosea (Excavata: Discoba) with description of seven new species|date=2014-07-01|accessdate=2023-11-01|doi=10.1099/ijs.0.063487-0|journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Biology|url=https://www.microbiologyresearch.org/docserver/fulltext/ijsem/64/7/2280_ijs063487.pdf|volume=64|issue=Pt 7}}</ref> |
||
Az ''Euplaesiobystra salpumilio'' esetén a sók aktív transzportja 75-100 PSU<ref group="*">Practical Salinity Unit: 1 PSU = 1 g/kg</ref> koncentrációjú oldatban a sejtbe, 150 PSU koncentrációjúban a sejtből történik.<ref name="Lee 2020">{{cite journal|author=Hyeon Been Lee, Dong Hyuk Jeong, Jong Soo Park|title=Accumulation patterns of intracellular salts in a new halophilic amoeboflagellate, ''Euplaesiobystra salpumilio'' sp. nov., ''(Heterolobosea; Discoba)'' under hypersaline conditions|journal=Front Microbiol.|date=2022-08-05|accessdate=2023-11-01|pmid=35992684|pmc=9389213|volume=13}}</ref> Ezenkívül legalább 4 ''Heterolobosea''-klád nagyon vagy kizárólagosan halofil.<ref name="Lee 2020"/> |
Az ''Euplaesiobystra salpumilio'' esetén a sók aktív transzportja 75-100 PSU<ref group="*">Practical Salinity Unit: 1 PSU = 1 g/kg</ref> koncentrációjú oldatban a sejtbe, 150 PSU koncentrációjúban a sejtből történik.<ref name="Lee 2020">{{cite journal|author=Hyeon Been Lee, Dong Hyuk Jeong, Jong Soo Park|title=Accumulation patterns of intracellular salts in a new halophilic amoeboflagellate, ''Euplaesiobystra salpumilio'' sp. nov., ''(Heterolobosea; Discoba)'' under hypersaline conditions|journal=Front Microbiol.|date=2022-08-05|accessdate=2023-11-01|pmid=35992684|pmc=9389213|volume=13}}</ref> Ezenkívül legalább 4 ''Heterolobosea''-klád nagyon vagy kizárólagosan halofil.<ref name="Lee 2020"/> |
||
===''Jakobida''=== |
|||
{{fő|Jakobida}} |
|||
A ''Jakobida'' szabadon élő heterotróf ostoros eukarióták rendje. Ezek kicsik, és aerob és anaerob környezetekben is élnek. <ref name=kelly1993>{{cite journal |last1=O'Kelly |first1=Charles J. |title=The Jakobid flagellates: structural features of Jakoba, Reclinomonas, and Histonia and implications for the early diversification of eukaryotes |journal=Journal of Eukaryotic Microbiology |year=1993 |volume=40 |issue=5 |pages=627–636|doi=10.1111/j.1550-7408.1993.tb06120.x |s2cid=85938682}}</ref><ref name=strassert2016>{{cite journal |last1=Strassert |first1=Jürgen F. H. |last2=Tikhonenov |first2=Denis V. |last3=Pombert |first3=Jean-François |last4=Kolisko |first4=Martin |last5=Tai |first5=Vera |last6=Mylnikov |first6=Alexander P. |last7=Keeling |first7=Patrick J. |title=Moramonas marocensis gen. nov., sp. nov.: a jakobid flagellate isolated from desert soil with a bacteria-like, but bloated mitochondrial genome |journal=Open Biology |year=2016 |volume=6 |issue=2 |pages=150239 |pmc=4772810 |pmid=26887409 |doi=10.1098/rsob.150239}}</ref><ref name=burger2013>{{cite journal |last1=Burger |first1=Gertraud |last2=Gray |first2=Michael W. |last3=Forget |first3=Lise |last4=Lang |first4=B. Franz |title=Strikingly Bacteria-Like and Gene-Rich Mitochondrial Genomes throughout Jakobid Protists |journal=Genome Biology and Evolution |year=2013 |volume=5 |issue=2 |pages=418–438 |doi=10.1093/gbe/evt008 |pmid=23335123 |pmc=3590771 }}</ref> A [[monofiletikus csoport|monofiletikusnak]] tekintett rendben jelenleg 20 ismert faj van, és 1993-ban ismerték el rendszertani csoportként.<ref name=kelly1993 /><ref name=burger2013 /><ref name=simpsonbook2017>{{cite book |last1=Simpson |first1=Alastair G. B. |editor1-last=Archibald |editor1-first=John M. |editor2-last=Simpson |editor2-first=Alastair G. B.|editor3-last=Slamovits |editor3-first=Claudio H. |title=Handbook of the Protists |publisher=Springer, Cham |pages=973–1003 |chapter=Jakobids|doi=10.1007/978-3-319-28149-0_6 |year=2017 |isbn=978-3-319-28147-6}}</ref> |
|||
Egy 2009-es tanulmány szerint mivel sok tenyésztetlen protisztaágat kevés, akár egy szekvencia is képviselhet, egy 2009-es tanulmány szerint igen sokrétű „ritka bioszférát” alkotnak.<ref name="Pánek 2015-11">{{cite journal|author=Tomáš Pánek, Petr Táborský, Maria G. Pachiadaki, Miluše Hroudová, Čestmír Vlček, Virginia P. Edgcomb, Ivan Čepička|title=Combined Culture-Based and Culture-Independent Approaches Provide Insights into Diversity of Jakobids, an Extremely Plesiomorphic Eukaryotic Lineage|date=2015-11-18|journal=Front Microbiol.|volume=6|page=1288|pmid=26635756|pmc=4649034|doi=10.3389/fmicb.2015.01288|accessdate=2023-11-01}}</ref> |
|||
===''Discicristata''=== |
|||
A ''Discicristata'' korábban feltételezett ''Excavata''-csoport volt, tagjai az [[ostoros moszatok]] ''(Euglenozoa)'' és a ''[[Percolozoa]]''.<ref name="pmid14657102">{{cite journal|author=T. Cavalier-Smith|title=The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa|journal=Int. J. Syst. Evol. Microbiol.|volume=53|issue=Pt 6|pp= 1741–58|year=2003|month=november|pmid=14657102|doi=10.1099/ijs.0.02548-0|url=http://ijs.sgmjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=14657102|doi-access=free}}</ref> Nem rendelkeznek ''[[Sun (fehérje)|Sun]]'' fehérjékkel vagy ''Tpr/Mlp''-homológokkal.<ref name="EOTN">{{Cite journal|title=Evolution of the nucleus|author=Damien P. Devos, Ralph Graf, Mark C. Field|year=2014|month=június|journal=Current Opinion in Cell Biology|accessdate=2023-11-01|pmid=24508984|pmc=4071446| url=https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0955067414000052|doi=10.1016/j.ceb.2014.01.004}}</ref> |
|||
==Fontosságuk== |
==Fontosságuk== |
||
A ''Discoba''-fajok mitokondriális genomjainak megismerése fontos a [[mtDNS]] fejlődésének megértéséhez.<ref name="Ettahi 2021"/> |
A ''Discoba''-fajok mitokondriális genomjainak megismerése fontos a [[mtDNS]] fejlődésének megértéséhez.<ref name="Ettahi 2021"/> |
||
A lap 2023. november 1., 12:36-kori változata
 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
| Rendszertani besorolás | ||||||
| ||||||
| Hivatkozások | ||||||
A Discoba az Excavata ország alországa. Neve a Discicristata és Jakobida csoportok neveinek összevonásából ered.[1] A Discoba tagja többek közt a Percolozoa, melynek egyetlen ismert fertőző faja az amőbás agyhártyagyulladást okozó Naegleria fowleri. A Discicristata és Jakobida csoportokon kívül a Discoba tagja még a Tsukubamonada.
A Discoba testvércsoportja egyes feltételezések szerint az Ophirinina.[2]
Jellemzői
A Discoba mitokondriumai általában lemezes cristákkal rendelkeznek. A Pleurostomum flabellatum cristái redukálódtak, így feltehetően redukálódott vagy megszűnt képessége a sejtlégzésre. A mitokondriális genomok hosszúak, például a P. flabellatumé 57 829 bázispár.[3]
Heterolobosea
Egy Heterolobosea-faj, az Acrasis kona mtDNS-éből a Heterolobosea többi fajára jellemző gének 40%-a hiányzik, ezenkívül e DNS-ben többszörös nyitott leolvasási keretek találhatók.[4] Ez a DNS körkörös, GC-tartalma alacsony (16,7%).[4] Az Acrasis konában pedig 26 ismert fehérjekódoló, 11 tRNS-gén és 10 feltételezett gén található.[4] Ez a faj továbbá képes RNS C→U módosítására is.[4]
A Naegleria fowleri és a Naegleria gruberi mtDNS-ei tartalmazzák a legtöbb gént a Jakobidán kívül 42 jelzett és 4 feltételezett génnel,[4] a legtöbb fehérjét és tRNS-t kódoló gént tartalmazó mtDNS pedig az Andalucia godoyié 66 génnel és 22 tRNS-génnel.[4]
Egyes Heterolobosea-fajok, például a Monopylocystis- és a Pseudoharpagon-fajok sós vízben, például tengervízben élnek.[5]
Az Euplaesiobystra salpumilio esetén a sók aktív transzportja 75-100 PSU[* 1] koncentrációjú oldatban a sejtbe, 150 PSU koncentrációjúban a sejtből történik.[6] Ezenkívül legalább 4 Heterolobosea-klád nagyon vagy kizárólagosan halofil.[6]
Jakobida
A Jakobida szabadon élő heterotróf ostoros eukarióták rendje. Ezek kicsik, és aerob és anaerob környezetekben is élnek. [7][8][9] A monofiletikusnak tekintett rendben jelenleg 20 ismert faj van, és 1993-ban ismerték el rendszertani csoportként.[7][9][10]
Egy 2009-es tanulmány szerint mivel sok tenyésztetlen protisztaágat kevés, akár egy szekvencia is képviselhet, egy 2009-es tanulmány szerint igen sokrétű „ritka bioszférát” alkotnak.[11]
Discicristata
A Discicristata korábban feltételezett Excavata-csoport volt, tagjai az ostoros moszatok (Euglenozoa) és a Percolozoa.[12] Nem rendelkeznek Sun fehérjékkel vagy Tpr/Mlp-homológokkal.[13]
Fontosságuk
A Discoba-fajok mitokondriális genomjainak megismerése fontos a mtDNS fejlődésének megértéséhez.[3]
Jegyzetek
- ↑ Rodríguez-Ezpeleta, Naiara (2007). „Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans”. Current Biology 17 (16), 1420–1425. o. DOI:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961. (Hozzáférés: 2023. október 31.)
- ↑ Luis Javier Galindo, Kristina Prokina, Guifré Torruella, Purificación López-García, David Moreira (2023. április). „Maturases and Group II Introns in the Mitochondrial Genomes of the Deepest Jakobid Branch”. Genome Biol Evol.. PMID 37029959. (Hozzáférés: 2023. október 31.)
- ↑ a b Khaoula Ettahi, Duckhyun Lhee, Ji Yeon Sung, Alastair G B Simpson, Jong Soo Park, Hwan Su Yoon (2021. február). „Evolutionary History of Mitochondrial Genomes in Discoba, Including the Extreme Halophile Pleurostomum flabellatum (Heterolobosea)”. DOI:10.1093/gbe/evaa241. PMID 33185659. (Hozzáférés: 2023. október 31.)
- ↑ a b c d e f Cheng-Jie Fu, Sanea Sheikh, Wei Miao, Siv G. E. Andersson, Sandra L. Baldauf (2014. szeptember). „Missing Genes, Multiple ORFs, and C-to-U Type RNA Editing in Acrasis kona (Heterolobosea, Excavata) Mitochondrial DNA”. Genome Biol. Evol. 6 (9), 2240–2257. o. PMID 25146648. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ Tomás Pánek, Eliška Plačková, Ivan Čepička (2014. július 1.). „Survey on diversity of marine/saline anaerobic Heterolobosea (Excavata: Discoba) with description of seven new species”. International Journal of Systematic and Evolutionary Biology 64 (Pt 7). DOI:10.1099/ijs.0.063487-0. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ a b Hyeon Been Lee, Dong Hyuk Jeong, Jong Soo Park (2022. augusztus 5.). „Accumulation patterns of intracellular salts in a new halophilic amoeboflagellate, Euplaesiobystra salpumilio sp. nov., (Heterolobosea; Discoba) under hypersaline conditions”. Front Microbiol. 13. PMID 35992684. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ a b (1993) „The Jakobid flagellates: structural features of Jakoba, Reclinomonas, and Histonia and implications for the early diversification of eukaryotes”. Journal of Eukaryotic Microbiology 40 (5), 627–636. o. DOI:10.1111/j.1550-7408.1993.tb06120.x.
- ↑ (2016) „Moramonas marocensis gen. nov., sp. nov.: a jakobid flagellate isolated from desert soil with a bacteria-like, but bloated mitochondrial genome”. Open Biology 6 (2), 150239. o. DOI:10.1098/rsob.150239. PMID 26887409.
- ↑ a b (2013) „Strikingly Bacteria-Like and Gene-Rich Mitochondrial Genomes throughout Jakobid Protists”. Genome Biology and Evolution 5 (2), 418–438. o. DOI:10.1093/gbe/evt008. PMID 23335123.
- ↑ Jakobids, Handbook of the Protists. Springer, Cham, 973–1003. o.. DOI: 10.1007/978-3-319-28149-0_6 (2017). ISBN 978-3-319-28147-6
- ↑ Tomáš Pánek, Petr Táborský, Maria G. Pachiadaki, Miluše Hroudová, Čestmír Vlček, Virginia P. Edgcomb, Ivan Čepička (2015. november 18.). „Combined Culture-Based and Culture-Independent Approaches Provide Insights into Diversity of Jakobids, an Extremely Plesiomorphic Eukaryotic Lineage”. Front Microbiol. 6, 1288. o. DOI:10.3389/fmicb.2015.01288. PMID 26635756. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
- ↑ T. Cavalier-Smith (2003. november). „The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 53 (Pt 6), 1741–58. o. DOI:10.1099/ijs.0.02548-0. PMID 14657102.
- ↑ Damien P. Devos, Ralph Graf, Mark C. Field (2014. június). „Evolution of the nucleus”. Current Opinion in Cell Biology. DOI:10.1016/j.ceb.2014.01.004. PMID 24508984. (Hozzáférés: 2023. november 1.)
Forráshivatkozás-hiba: <ref> címkék léteznek a(z) „*” csoporthoz, de nincs hozzá <references group="*"/>