Euryarchaeota

A Wikipédiából, a szabad enciklopédiából
Wikipédia:TaxoboxInfobox info icon.svg
Euryarchaeota
Halobacterium sp. NRC-1 törzs, a sejtek kb. 5 µm hosszúak
Halobacterium sp. NRC-1 törzs, a sejtek kb. 5 µm hosszúak
Rendszertani besorolás
Domén: Archeák (Archaea)
Ország: Euryarchaeota [1]
Törzs: Euryarchaeota
Woese, Kandler & Wheelis, 1990
Szinonimák
  • Euryarchaeota Woese et al. 1990
  • Euryarchaeota Garrity and Holt 2002
  •  !nem! Euryarchaeota Cavalier-Smith 2002
Osztályok
Hivatkozások
Wikispecies

A Wikifajok tartalmaz Euryarchaeota témájú rendszertani információt.

Commons

A Wikimédia Commons tartalmaz Euryarchaeota témájú kategóriát.

A mikroorganizmusok rendszertanában az Euryarchaeota az Archaea domén egyik törzse, illetve országa.[2][3][4]

Közéjük tartoznak a metanogének, melyek metánt termelnek és gyakran a bélflóra részét képezik, a halobaktériumok, melyek extrém sókoncentráció elviselésére képesek és néhány rendkívül termofil aerob, illetve anaerob élőlény. A többi archeától leginkább riboszomális RNS-szekvenciák alapján különböztetik meg őket.

Törzsfejlődés[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]

A jelenleg elfogadott rendszertan a List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) listán[5] és az National Center for Biotechnology Information (NCBI) adatbázisán[6] alapul, a leszármazási fát a 'The All-Species Living Tree' Project[7] 16S rRNA-alapú LTP release 111-e alapján állították össze.



?Aciduliprofundum booneiReysenbach et al. 2006



?'Candidatus Methanomethylophilus alvus' Borrel et al. 2012



?'Candidatus Micrarchaeum acidiphilum' Baker et al. 2010



?'Candidatus Parvarchaeum acidiphilum' Baker et al. 2010



?Nanohaloarchaea



Methanopyrus kandleri




Methanococcales



Eurythermea

Thermococcaceae




Methanomassiliicoccus luminyensis



Thermoplasmatales




Neobacteria

Methanobacteriales




Archaeoglobaceae


Halomebacteria

Methanomicrobia



Halobacteriaceae








Jegyzet:
♠ A törzs megtalálható az National Center for Biotechnology Information (NCBI) listáján, de hiányzik a List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) listájáról.

Kapcsolódó szócikkek[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]

Jegyzetek[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]

  1. Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (1990.). „Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya”. Proc Natl Acad Sci U S A 87 (12), 4576–9. o. PMID 2112744.  
  2. See the NCBI webpage on Euryarchaeota
  3. C.Michael Hogan. 2010. Archaea. eds. E.Monosson & C.Cleveland, Encyclopedia of Earth. National Council for Science and the Environment, Washington DC.
  4. Data extracted from the NCBI taxonomy resources. National Center for Biotechnology Information. (Hozzáférés: 2007. március 19.)
  5. J.P. Euzéby: Euryarchaeota. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1]. (Hozzáférés: 2013. március 20.)
  6. Sayers et al.: Euryarchaeota. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database [2]. (Hozzáférés: 2013. március 20.)
  7. 'The All-Species Living Tree' Project.16S rRNA-based LTP release 111 (full tree). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database [3]. (Hozzáférés: 2013. március 20.)

Irodalom[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]

Tudományos cikkek[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]

  • Cavalier-Smith, T (2002.). „The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 1), 7–76. o. PMID 11837318.  
  • Stackebrandt, E, Frederiksen W, Garrity GM, Grimont PA, Kampfer P, Maiden MC, Nesme X, Rossello-Mora R, Swings J, Truper HG, Vauterin L, Ward AC, Whitman WB (2002.). „Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 3), 1043–1047. o. DOI:10.1099/ijs.0.02360-0. PMID 12054223.  
  • Christensen, H, Bisgaard M, Frederiksen W, Mutters R, Kuhnert P, Olsen JE (2001.). „Is characterization of a single isolate sufficient for valid publication of a new genus or species? Proposal to modify recommendation 30b of the Bacteriological Code (1990 Revision)”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 6), 2221–2225. o. DOI:10.1099/00207713-51-6-2221. PMID 11760965.  
  • Gurtler, V, Mayall BC (2001.). „Genomic approaches to typing, taxonomy and evolution of bacterial isolates”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 1), 3–16. o. PMID 11211268.  
  • Dalevi, D, Hugenholtz P, Blackall LL (2001.). „A multiple-outgroup approach to resolving division-level phylogenetic relationships using 16S rDNA data”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2), 385–391. o. PMID 11321083.  
  • Keswani, J, Whitman WB (2001.). „Relationship of 16S rRNA sequence similarity to DNA hybridization in prokaryotes”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2), 667–678. o. PMID 11321113.  
  • Young, JM (2001.). „Implications of alternative classifications and horizontal gene transfer for bacterial taxonomy”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 3), 945–953. o. DOI:10.1099/00207713-51-3-945. PMID 11411719.  
  • Christensen, H, Angen O, Mutters R, Olsen JE, Bisgaard M (2000.). „DNA-DNA hybridization determined in micro-wells using covalent attachment of DNA”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (3), 1095–1102. o. DOI:10.1099/00207713-50-3-1095. PMID 10843050.  
  • Xu, HX, Kawamura Y, Li N, Zhao L, Li TM, Li ZY, Shu S, Ezaki T (2000.). „A rapid method for determining the G+C content of bacterial chromosomes by monitoring fluorescence intensity during DNA denaturation in a capillary tube”. Int. J. Syst.Evol. Microbiol. 50 (4), 1463–1469. o. DOI:10.1099/00207713-50-4-1463. PMID 10939651.  
  • Young, JM (2000.). „Suggestions for avoiding on-going confusion from the Bacteriological Code”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4), 1687–1689. o. DOI:10.1099/00207713-50-4-1687. PMID 10939677.  
  • Hansmann, S, Martin W (2000.). „Phylogeny of 33 ribosomal and six other proteins encoded in an ancient gene cluster that is conserved across prokaryotic genomes: influence of excluding poorly alignable sites from analysis”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4), 1655–1663. o. DOI:10.1099/00207713-50-4-1655. PMID 10939673.  
  • Tindall, BJ (1999.). „Proposal to change the Rule governing the designation of type strains deposited under culture collection numbers allocated for patent purposes”. Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3), 1317–1319. o. DOI:10.1099/00207713-49-3-1317. PMID 10490293.  
  • Tindall, BJ (1999.). „Proposal to change Rule 18a, Rule 18f and Rule 30 to limit the retroactive consequences of changes accepted by the ICSB”. Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3), 1321–1322. o. DOI:10.1099/00207713-49-3-1321. PMID 10425797.  
  • Tindall, BJ (1999.). „Misunderstanding the Bacteriological Code”. Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3), 1313–1316. o. DOI:10.1099/00207713-49-3-1313. PMID 10425796.  
  • Tindall, BJ (1999.). „Proposals to update and make changes to the Bacteriological Code”. Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3), 1309–1312. o. DOI:10.1099/00207713-49-3-1309. PMID 10425795.  
  • Palys, T, Nakamura LK, Cohan FM (1997.). „Discovery and classification of ecological diversity in the bacterial world: the role of DNA sequence data”. Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (4), 1145–1156. o. DOI:10.1099/00207713-47-4-1145. PMID 9336922.  
  • Euzeby, JP (1997.). „List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet”. Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (2), 590–592. o. DOI:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.  
  • Clayton, RA, Sutton G, Hinkle PS Jr, Bult C, Fields C (1995.). „Intraspecific variation in small-subunit rRNA sequences in GenBank: why single sequences may not adequately represent prokaryotic taxa”. Int. J. Syst. Bacteriol. 45 (3), 595–599. o. DOI:10.1099/00207713-45-3-595. PMID 8590690.  
  • Murray, RG, Schleifer KH (1994.). „Taxonomic notes: a proposal for recording the properties of putative taxa of procaryotes”. Int. J. Syst. Bacteriol. 44 (1), 174–176. o. DOI:10.1099/00207713-44-1-174. PMID 8123559.  
  • Winker, S, Woese CR (1991.). „A definition of the domains Archaea, Bacteria and Eucarya in terms of small subunit ribosomal RNA characteristics”. Syst. Appl. Microbiol. 14 (4), 305–310. o. PMID 11540071.  
  • Woese, CR, Kandler O, Wheelis ML (1990.). „Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya”. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87 (12), 4576–4579. o. DOI:10.1073/pnas.87.12.4576. PMID 2112744.  
  • Achenbach-Richter, L, Woese CR (1988.). „The ribosomal gene spacer region in archaebacteria”. Syst. Appl. Microbiol. 10, 211–214. o. PMID 11542149.  
  • McGill, TJ, Jurka J, Sobieski JM, Pickett MH, Woese CR, Fox GE (1986.). „Characteristic archaebacterial 16S rRNA oligonucleotides”. Syst. Appl. Microbiol. 7 (2–3), 194–197. o. DOI:10.1016/S0723-2020(86)80005-4. PMID 11542064.  
  • Woese, CR, Olsen GJ (1984.). „The phylogenetic relationships of three sulfur dependent archaebacteria”. Syst. Appl. Microbiol. 5, 97–105. o. DOI:10.1016/S0723-2020(84)80054-5. PMID 11541975.  
  • Woese, CR, Fox GE (1977.). „Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms”. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74 (11), 5088–5090. o. DOI:10.1073/pnas.74.11.5088. PMID 270744.  

Szakkönyvek[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]

  • Garrity GM, Holt JG.szerk.: DR Boone and RW Castenholz, eds.: Phylum AII. Euryarchaeota phy. nov., Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria, 2nd, New York: Springer Verlag, 169. o (2001). ISBN 978-0-387-98771-2 

Tudományos adatbázisok[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]

További információk[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]