POLG2

A Wikipédiából, a szabad enciklopédiából
POLG2
Azonosítók
JelPOLG2
Entrez11232
OMIM604983
RefSeqNM_007215
UniProtQ9UHN1
PDB2G4C
Egyéb adatok
Lokusz17. krom. q23.3

A mitokondriális DNS-polimeráz γ, 2. alegység a POLG2 gén által kódolt fehérje. 55 kDa-os kiegészítő egység, mely a DNS-polimeráz γ katalitikus alegységének, a POLG-nak processzivitását és sótűrését adja.[1][2] Mutációi autoszomális domináns progresszív külső oftalmoparézist okoznak mitokondriális DNS-deléciókkal.[3]

Szerkezet[szerkesztés]

A POLG2 a 17. kromoszóma q karjának 23.3 sávján található, és 8 exonja van.[3] Az általa kódolt POLG2 fehérje foszfoszerint tartalmaz a 38. helyen, valamint egy tranzitpeptidet. 25 β-redőből, 21 α-hélixből és 8 fordulóból áll.[4][5]

A 436–466. aminosav az emlősök közt nagyrészt állandósult szekvenciát tartalmaz.[6]

Funkció[szerkesztés]

A POLG2 kódolja a DNS-polimeráz γ processzivitást biztosító alegységét. A DNS-polimeráz γ heterotrimert alkot 1 katalitikus és 2 kiegészítő alegységgel. Növeli a DNS-kötést, stimulálja a DNS-polimeráz- és exonukleázaktivitást, és elősegíti a processzív DNS-szintézist.[3][4][5] 1 POLG és 2 POLG2 együtt alkoják a DNS-polimeráz γ holoenzimet.[7]

Katalitikus aktivitás[szerkesztés]

A reakciót katalizálja.[4][5]

Klinikai jelentőség[szerkesztés]

Mitokondriális deléciós progresszív külső oftalmoparézis[szerkesztés]

A POLG2 mutációi összefüggnek a mitokondriális deléciós progresszív külső oftalmoparézissel. Ez a szemizmok és a felső szemhéj levator izmának fokozatos gyengülését, ezenkívül jelentkezhet vázizom-miopátiával, hályogokkal, hallásvesztéssel, érzőaxon-neuropátiával, ataxiával, depresszióval, hipogonadizmussal és parkinsonizmussal. E sokszervi betegség a Pol γ-alegységeket zavaró G451E mutációhoz kapcsolódik.[4][5][8]

Krónikus hepatitis C esetén a DDX5 minor alléljének vagy a DDX5-POLG2 haplotípus hordozóinak feltehetően nagyobb az előrehaladottfibrózis-kockázata. Fontos azonban, hogy a CPT1A minor allél hordozói feltehetően kisebb kockázatnak vannak kitéve.[9]

Egy deléciót tartalmazó POLG2-változat nem tud dimerizálódni az ehhez szükséges felület nagy részének hiánya miatt, így kisebb a processzív DNS-szintézist stimuláló képessége. E változat sokkal később ülepszik le.[7]

Rák[szerkesztés]

Feltételezett összefüggést találtak a tüdő-, illetve a fej-nyaki rák, valamint a POLG2-mutációk közt Michiels et al. 2007-ben, azonban a hamis felfedezések aránya igen nagy – 25–55% volt e tanulmányban, s bizonyos haplotípusok esetén elérhette akár a 86%-ot is.[10]

Kölcsönhatások[szerkesztés]

A POLG2 39 biner fehérje–fehérje kölcsönhatásban vesz részt, 19 kokomplex kölcsönhatással. A POLG2 elsősorban a POLG-vel kölcsönhat.[11]

Ortológok[szerkesztés]

A POLG2-nek ismert ortológja a gerincesekben és Drosophila melanogasterben, azonban utóbbi nem dimerizálódik.[7]

Jegyzetek[szerkesztés]

  1. Wang Y, Farr CL, Kaguni LS (1997. május 1.). „Accessory subunit of mitochondrial DNA polymerase from Drosophila embryos. Cloning, molecular analysis, and association in the native enzyme”. The Journal of Biological Chemistry 272 (21), 13640–6. o. DOI:10.1074/jbc.272.21.13640. PMID 9153213.  
  2. Lim SE, Longley MJ, Copeland WC (1999. december 1.). „The mitochondrial p55 accessory subunit of human DNA polymerase gamma enhances DNA binding, promotes processive DNA synthesis, and confers N-ethylmaleimide resistance”. The Journal of Biological Chemistry 274 (53), 38197–203. o. DOI:10.1074/jbc.274.53.38197. PMID 10608893.  
  3. a b c Entrez Gene: POLG2 polymerase (DNA directed), gamma 2, accessory subunitPublic Domain Ez a cikk ebből a forrásból származó szöveget tartalmaz, amely közkincs.
  4. a b c d POLG2 - DNA polymerase subunit gamma-2, mitochondrial precursor - Homo sapiens (Human) - POLG2 gene & protein (angol nyelven). www.uniprot.org . (Hozzáférés: 2018. augusztus 31.)Sablon:CC-notice
  5. a b c d (2017. január 1.) „UniProt: the universal protein knowledgebase”. Nucleic Acids Research 45 (D1), D158–D169. o. DOI:10.1093/nar/gkw1099. PMID 27899622.  
  6. Longley MJ, Clark S, Yu Wai Man C, Hudson G, Durham SE, Taylor RW, Nightingale S, Turnbull DM, Copeland WC, Chinnery PF (2006. június 1.). „Mutant POLG2 disrupts DNA polymerase gamma subunits and causes progressive external ophthalmoplegia”. American Journal of Human Genetics 78 (6), 1026–34. o. DOI:10.1086/504303. PMID 16685652.  
  7. a b c Yakubovskaya E, Chen Z, Carrodeguas JA, Kisker C, Bogenhagen DF (2006. január 1.). „Functional human mitochondrial DNA polymerase gamma forms a heterotrimer”. The Journal of Biological Chemistry 281 (1), 374–82. o. DOI:10.1074/jbc.M509730200. PMID 16263719.  
  8. Longley MJ, Clark S, Yu Wai Man C, Hudson G, Durham SE, Taylor RW, Nightingale S, Turnbull DM, Copeland WC, Chinnery PF (2006. június 1.). „Mutant POLG2 disrupts DNA polymerase gamma subunits and causes progressive external ophthalmoplegia”. American Journal of Human Genetics 78 (6), 1026–34. o. DOI:10.1086/504303. PMID 16685652.  
  9. Huang H, Shiffman ML, Cheung RC, Layden TJ, Friedman S, Abar OT, Yee L, Chokkalingam AP, Schrodi SJ, Chan J, Catanese JJ, Leong DU, Ross D, Hu X, Monto A, McAllister LB, Broder S, White T, Sninsky JJ, Wright TL (2006. május 1.). „Identification of two gene variants associated with risk of advanced fibrosis in patients with chronic hepatitis C”. Gastroenterology 130 (6), 1679–87. o. [2017. szeptember 21-i dátummal az eredetiből archiválva]. DOI:10.1053/j.gastro.2006.02.032. PMID 16697732. (Hozzáférés: 2024. március 15.)  
  10. Michiels S, Danoy P, Dessen P, Bera A, Boulet T, Bouchardy C, Lathrop M, Sarasin A, Benhamou S (2007. augusztus 1.). „Polymorphism discovery in 62 DNA repair genes and haplotype associations with risks for lung and head and neck cancers”. Carcinogenesis 28 (8), 1731–9. o. DOI:10.1093/carcin/bgm111. PMID 17494052.  
  11. 39 binary interactions found for search term POLG2. IntAct. EMBL-EBI. (Hozzáférés: 2019. szeptember 4.)

Fordítás[szerkesztés]

Ez a szócikk részben vagy egészben a POLG2 című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

További információk[szerkesztés]

  • Huang H, Shiffman ML, Cheung RC, Layden TJ, Friedman S, Abar OT, Yee L, Chokkalingam AP, Schrodi SJ, Chan J, Catanese JJ, Leong DU, Ross D, Hu X, Monto A, McAllister LB, Broder S, White T, Sninsky JJ, Wright TL (2006. május 1.). „Identification of two gene variants associated with risk of advanced fibrosis in patients with chronic hepatitis C”. Gastroenterology 130 (6), 1679–87. o. [2017. szeptember 21-i dátummal az eredetiből archiválva]. DOI:10.1053/j.gastro.2006.02.032. PMID 16697732. (Hozzáférés: 2024. március 15.)  
  • Carrodeguas JA, Pinz KG, Bogenhagen DF (2002. december 1.). „DNA binding properties of human pol gammaB”. The Journal of Biological Chemistry 277 (51), 50008–14. o. DOI:10.1074/jbc.M207030200. PMID 12379656.  
  • Johnson AA, Tsai Y, Graves SW, Johnson KA (2000. február 1.). „Human mitochondrial DNA polymerase holoenzyme: reconstitution and characterization”. Biochemistry 39 (7), 1702–8. o. DOI:10.1021/bi992104w. PMID 10677218.  
  • Carrodeguas JA, Bogenhagen DF (2000. március 1.). „Protein sequences conserved in prokaryotic aminoacyl-tRNA synthetases are important for the activity of the processivity factor of human mitochondrial DNA polymerase”. Nucleic Acids Research 28 (5), 1237–44. o. DOI:10.1093/nar/28.5.1237. PMID 10666468.  
  • Lim SE, Longley MJ, Copeland WC (1999. december 1.). „The mitochondrial p55 accessory subunit of human DNA polymerase gamma enhances DNA binding, promotes processive DNA synthesis, and confers N-ethylmaleimide resistance”. The Journal of Biological Chemistry 274 (53), 38197–203. o. DOI:10.1074/jbc.274.53.38197. PMID 10608893.