Citokróm c-reduktáz

A Wikipédiából, a szabad enciklopédiából
UCR_TM
Ubikinonhoz kapcsolódó mitokondriális citokróm bc komplex kristályszerkezete.[1]
Ubikinonhoz kapcsolódó mitokondriális citokróm bc komplex kristályszerkezete.[1]
Azonosítók
JelUCR_TM
Egyéb adatok
LokuszMitokondrium [1]
ubikinol–citokróm c-reduktáz
px
Azonosítók
Jel{{{Symbol}}}
Egyéb adatok
Lokusz8. krom. p14
A III. komplex reakcióinak rajza

A koenzim Q:citokróm c-oxidoreduktáz, más néven citokróm bc1 komplex vagy III. komplex az elektrontranszportlánc 3. komplexe (EC 1.10.2.2), mely fontos az ATP-szintézisben (oxidatív foszforiláció). Több alegységből álló fehérje, melyet a mitokondriális (citokróm b) és a sejtmagi genomok (más alegységek) is kódolnak. A III. komplex az aerob eukarióták mitokondriumaiban és a legtöbb eubaktérium belső membránjában jelen van. A III. komplex mutációi edzésintolerancia és sokszervi betegségek okozói. A bc1 komplex 11 alegységből áll, ebből 2 légzési (citokróm b, c1, Rieske-fehérje), 2 magfehérje és 6 alacsony molekulatömegű fehérje. Az ubikinol–citokróm c-reduktáz az alábbi reakciót katalizálja:

QH2 + 2 Cyt c3+ Q + 2 Cyt c2+ + 2 H+

Így az enzim két szubsztrátja a kinol (QH2) és az oxidált (Fe3+) citokróm c, a termékek a kinon (Q), a redukált (Fe2+) citokróm c és két proton (H+).

Az enzim difenolokat és hasonló vegyületeket donorként, az oxidált citokróm c-t akceptorként használó oxidoreduktáz. 4 kofaktora van: a citokróm c1, a citokróm b-562, a citokróm b-566 és a két vasat tartalmazó Rieske-típusú ferredoxin.

Nevezéktan[szerkesztés]

Az enzimosztály szabályos neve ubikinol:ferricitokróm c-oxidoreduktáz. További gyakran használt nevek:

  • koenzim Q-citokróm c reduktáz,
  • dihidrokoenzim Q–citokróm c reduktáz,
  • reduckált ubikinon–citokróm c-reduktáz,
  • III. komplex (mitokondriális elektrontranszport),
  • ubikinon–citokróm c-reduktáz.

Szerkezet[szerkesztés]

A III. komplex szerkezete

Más nagy protonpumpákhoz képest az alegységszám kicsi, akár 3 polipeptidlánc is lehet. E szám fejlettebb állatokban akár 11 is lehet.[2] 3 alegységen van prosztetikus csoport. A citokróm b-n két hem b (bL és bH), a citokróm c-n egy hem c (c1) van, a Rieske vas-kén fehérjealegységen (ISP) két vasat és két ként tartalmazó vas-kén csoport található (2Fe•2S).

A III. komplex szerkezetei: PDB: 1KYO, PDB: 1L0L

Összetétel[szerkesztés]

Gerincesekben a bc1 komplex 11 alegységből áll: 3 légzési, 2 központi és 6 alacsony molekulatömegű részből.[3][4] A proteobakteriális komplexek azonban akár 3 részesek is lehetnek.[5]

A III. komplex összetételének táblázata[szerkesztés]

Szám Név Humán protein Fehérje leírása a UniProton Humán fehérje Pfam-családja
Légzési alegységek
1 MT-CYB / Cyt b CYB_HUMAN Citokróm b Pfam PF13631
2 CYC1 / Cyt c1 CY1_HUMAN Citokróm c1, mitokondriális hemoprotein Pfam PF02167
3 Rieske / UCR1 UCRI_HUMAN Citokróm b-c1 komplex mitokondriális Rieske-alegysége EC 1.10.2.2 Pfam PF02921 , Pfam PF00355
Központi részek
4 QCR1 / SU1 QCR1_HUMAN Citokróm b-c1 komplex mitokondriális 1. alegysége Pfam PF00675, Pfam PF05193
5 QCR2 / SU2 QCR2_HUMAN Citokróm b-c1 komplex mitokondriális 2. alegysége Pfam PF00675, Pfam PF05193
Alacsony molekulatömegű részek
6 QCR6 / SU6 QCR6_HUMAN Citokróm b-c1 komplex 6. mitokondriális alegysége Pfam PF02320
7 QCR7 / SU7 QCR7_HUMAN Citokróm b-c1 komplex 7. alegysége Pfam PF02271
8 QCR8 / SU8 QCR8_HUMAN Citokróm b-c1 komplex 8. alegysége Pfam PF02939
9 QCR9 / SU9 / UCRC QCR9_HUMANa Cytochrome b-c1 complex subunit 9 Pfam PF09165
10 QCR10 / SU10 QCR10_HUMAN Cytochrome b-c1 complex subunit 10 Pfam PF05365
11 QCR11 / SU11 QCR11_HUMAN Cytochrome b-c1 complex subunit 11 Pfam PF08997
  • a Gerincesekben egy 8 kDa-os termék a Rieske-fehérjének N-terminusán 9. alegységként megmarad. A 10. és 11. alegységek a gomba QCR9p és 10p egységeknek felelnek meg.

Reaction[szerkesztés]

A koenzim Q oxidációjával és 4 proton mitokondriumból membránközi térbe való kerülésével járó citokróm c-redukciót katalizálja:

QH2 + 2 Cyt c (Fe3+) + 2 H+in → Q + 2 Cyt c (Fe2+) + 4 H+out

A Q-ciklus során[6][7] 2 proton fogy a mátrixból (M), 4 proton kerül a membránközi térbe (IM) és 2 elektront kap a citokróm c.

Reakciómechanizmus[szerkesztés]

A Q-ciklus

A III. komplex reakciómechanizmusa az ubikinon- (Q-) ciklus. Ebben 4 proton kerül a pozitív (P) oldalra (membránközi tér), és 2-t vesz fel a negatív (N) oldal (mátrix), a membránra merőleges protongradienst létrehozva. A reakcióban 2 ubikinol alakul ubikinonná, és 1 ubikinon ubikinollá. A teljes reakcióban 2 elektron kerül át az ubikinolról az ubikinonra két citokróm c-intermedierrel.

Összesített reakció:

  • 2 QH2 oxidálódik Q-ra
  • 1 Q redukálódik QH2-re
  • 2 Cyt c redukálódik
  • 4 proton kerül az intermembrán térbe
  • 2 protont vesz a mátrix fel

A reakció az alábbi lépésekben történik:

1. rész:

  1. A citokróm b egy ubikinolt és egy ubikinont köt.
  2. A 2Fe/2S központ és a hem BL egy-egy elektront vesznek le az ubikinolról, 2 protont adva az intermembrán térbe.
  3. 1 elektron kerül át a citokróm c1-re a 2Fe/2S központról, egy másik a hem BL-ről a hem BH-ra.
  4. A citokróm c1 elektronját a citokróm c-re, a hem BH egy közeli ubikinonra viszi át, ubiszemikinon keletkezését okozva.
  5. A citokróm c diffundál. Az első, ubikinonná vált ubikinol felszabadul, a szemikinon kötve marad.

2. rész:

  1. A citokróm b újabb ubikinolt köt.
  2. A 2Fe/2S központ és a hem BL egy-egy elektront választanak le az ubikinolról, 2 protont az intermembrán térbe adva.
  3. 1 elektron kerül át a citokróm c1-re a 2Fe/2S központról, egy másik a hem BL-ről a hem BH-ra.
  4. A citokróm c1 elektronját a citokróm c-re viszi át, az 1. részben keletkezett szemikinon a hem BH-ról felveszi a második elektront a mátrix két protonjával együtt.
  5. A második ubikinol (ubikinonként), valamint az új ubikinol kijönnek.[8]

III. komplex-gátlók[szerkesztés]

3 különböző III. komplex-inhibitor-csoport van:

  • az antimicin A a Qi helyre köt, gátolva az elektrontranszfert a hem bH-ról az oxidált Q-ra (Qi helyi inhibitor)
  • a mixotiazol és a stigmatellin a Qo helyre köt, gátolva a redukált QH2-ről a Rieske vas-kén fehérjére való transzfert. A mixotiazol különböző, de átfedő helyeken kötnek a Qo helyen: a mixotiazol a citokróm bL-hez közelebb köt („proximális” inhibitor), a stigmatellin távolabb köt a hem bL-től és közelebb a Rieske vas-kén fehérjéhez, mellyel erősen kölcsönhat.

Ezek közül néhányat fungicidként (strobilurinszármazékok, például az azoxistrobin; QoI-gátlók) és antimaláriás szerként (atovakon) forgalomba hoztak.

A propilhexedrin is gátolja a citokróm c-reduktázt.[9]

Oxigén szabad gyökök[szerkesztés]

Néhány elektron az elektrontranszportláncot a IV. komplex elérése előtt elhagyja. Az elektronok idő előtti kilépése az oxigénre szuperoxid képződését okozza. E reakció azért fontos, mert a szuperoxid és más reaktív oxigénrészecskék erősen mérgezőek, és feltehetően számos betegségben szerepet játszhatnak (vö. szabadgyök-elmélet az öregedésről).[10] Az elektronszivárgás gyakran a Qo helyen történik, ezt az antimicin A stimulálja. Az antimicin A a b hemet redukált állapotban hagyja Qi helyen történő újraoxidációjuk megakadályozásával, ami növeli a Qo szemikinon egyensúlyi koncentrációját, mely az oxigénnel szuperoxidot alkotva reagál. A magas membránpotenciál feltehetően hasonló hatással jár.[11] A Qo helyen keletkező szuperoxid a mitokondriális mátrixba[12][13] és az intermembrán térbe is kerülhet, ahonnan elérheti a citoszolt.[12][14] Ezt magyarázhatja, hogy a III. komplex a szuperoxidot membránpermeábilis HOO-ként állítja elő, nem O-•2-ként.[13]

Humán gének[szerkesztés]

  • MT-CYB: mtDNS által kódolt citokróm b, mutációi összefüggenek az edzésintoleranciával
  • CYC1: citokróm c1
  • CYCS: citokróm c
  • UQCRFS1: Rieske vas-kén fehérje
  • UQCRB: ubikinonkötő fehérje, mutációi a magi 3. típusú mitokondriális III. komplex-hiánnyal függnek össze
  • UQCRH: kapcsolófehérje
  • UQCRC2: 2. magrész, mutációi a magi 5. típusú mitokondriális III. komplex-hiánnyal függnek össze
  • UQCRC1: 1. magrész
  • UQCR: 6,4 kDa-os alegység
  • UQCR10: 7,2 kDa-os alegység
  • TTC19: újonnan azonosított alegység, mutációi a magi 2. típusú mitokondriális III. komplex-hiánnyal függnek össze

A III. komplex génjeinek betegségokozó mutációi[szerkesztés]

A III. komplexhez kapcsolódó gének mutációinál általában edzésintolerancia jelentkezik.[15][16] Más mutációk szeptooptikus diszpláziát[17] és sokszervi rendellenességeket okoznak.[18] A III. komplex megfelelő éréséért felelő BCSIL gén mutációi Björnstad- és GRACILE-szindrómához vezetnek, melyek újszülöttekben halálos rendellenességek sokszervi és neurológiai tünetekkel, melyek a súlyos mitokondriális rendellenességekre jellemzők. A mutációk patogenicitását modellrendszerekben, például élesztőben igazolták.[19]

A betegségek bioenergetikai hiányosságokra és szuperoxid-túltermelésre való visszavezethetőségének mértéke jelenleg (2023) ismeretlen.

Jegyzetek[szerkesztés]

  1. PDB: 1ntz; (2003. augusztus 1.) „Structural basis for the quinone reduction in the bc1 complex: a comparative analysis of crystal structures of mitochondrial cytochrome bc1 with bound substrate and inhibitors at the Qi site”. Biochemistry 42 (30), 9067–80. o. DOI:10.1021/bi0341814. PMID 12885240.  
  2. (1998. július 1.) „Complete structure of the 11-subunit bovine mitochondrial cytochrome bc1 complex”. Science 281 (5373), 64–71. o. DOI:10.1126/science.281.5373.64. PMID 9651245.  
  3. (1998) „Electron transfer by domain movement in cytochrome bc1.”. Nature 392 (6677), 677–684. o. DOI:10.1038/33612. PMID 9565029.  
  4. (2012) „Computational discovery of picomolar Q(o) site inhibitors of cytochrome bc1 complex.”. J Am Chem Soc 134 (27), 11168–76. o. DOI:10.1021/ja3001908. PMID 22690928.  
  5. (1986) „Purification of a three-subunit ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase complex from Paracoccus denitrificans”. J Biol Chem 261 (26), 12282–9. o. DOI:10.1016/S0021-9258(18)67236-9. PMID 3017970.  
  6. Q-Cycle Bypass Reactions at the Qo Site of the Cytochrome bc1 (And Related) Complexes, Quinones and Quinone Enzymes, Part B, Methods in Enzymology, 21–45. o.. DOI: 10.1016/S0076-6879(04)82002-0 (2004). ISBN 978-0-12-182786-1 
  7. Crofts AR (2004). „The cytochrome bc1 complex: function in the context of structure”. Annu. Rev. Physiol. 66, 689–733. o. DOI:10.1146/annurev.physiol.66.032102.150251. PMID 14977419.  
  8. Bioenergetics, 3rd, San Diego: Academic, 114–117. o. (2002). ISBN 978-0-12-518121-1 
  9. (1975) „Inhibitory effect of anti-obesity drugs on NADH dehydrogenase of mouse heart homogenates”. Research Communications in Chemical Pathology and Pharmacology 11 (4), 645–6. o. PMID 241101.  
  10. Muller, F. L. (2007). „Trends in oxidative aging theories”. Free Radic. Biol. Med. 43 (4), 477–503. o. DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2007.03.034. PMID 17640558.  
  11. Skulachev VP (1996. május 1.). „Role of uncoupled and non-coupled oxidations in maintenance of safely low levels of oxygen and its one-electron reductants”. Q. Rev. Biophys. 29 (2), 169–202. o. DOI:10.1017/s0033583500005795. PMID 8870073.  
  12. a b Muller F (2000). „The nature and mechanism of superoxide production by the electron transport chain: Its relevance to aging”. AGE 23 (4), 227–253. o. DOI:10.1007/s11357-000-0022-9. PMID 23604868.  
  13. a b (2004. november 1.) „Complex III releases superoxide to both sides of the inner mitochondrial membrane”. J. Biol. Chem. 279 (47), 49064–73. o. DOI:10.1074/jbc.M407715200. PMID 15317809.  
  14. (2001. január 1.) „Mitochondrial respiratory chain-dependent generation of superoxide anion and its release into the intermembrane space”. Biochem. J. 353 (Pt 2), 411–6. o. DOI:10.1042/0264-6021:3530411. PMID 11139407.  
  15. DiMauro S (2006. november 1.). „Mitochondrial myopathies”. Curr Opin Rheumatol 18 (6), 636–641. o. DOI:10.1097/01.bor.0000245729.17759.f2. PMID 17053512.  
  16. DiMauro S (2007. június 1.). „Mitochondrial DNA medicine”. Biosci. Rep. 27 (1–3), 5–9. o. DOI:10.1007/s10540-007-9032-5. PMID 17484047.  
  17. (2002. március 1.) „Septo-optic dysplasia associated with a new mitochondrial cytochrome b mutation”. Ann. Neurol. 51 (3), 388–392. o. DOI:10.1002/ana.10151. PMID 11891837.  
  18. (2001. október 1.) „Multisystem disorder associated with a missense mutation in the mitochondrial cytochrome b gene”. Ann. Neurol. 50 (4), 540–543. o. DOI:10.1002/ana.1224. PMID 11601507.  
  19. (2004. március 1.) „Human disease-related mutations in cytochrome b studied in yeast”. J. Biol. Chem. 279 (13). DOI:10.1074/jbc.M313866200. PMID 14718526.  

Fordítás[szerkesztés]

Ez a szócikk részben vagy egészben a Coenzyme Q – cytochrome c reductase című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

Források[szerkesztés]

Kapcsolódó szócikkek[szerkesztés]

További információk[szerkesztés]