Pályafutását a Steaua Bucureștiben kezdte, melynek színeiben 1993-ban bemutatkozott a román első osztályban. Összesen öt bajnoki címet szerzett a Steaua játékosaként. Ezután 1997-ben a török Galatasarayhoz igazolt, ahol két idény alatt kétszer is török bajnoki címet ünnepelhetett. 1999-ben a Real Betis szerződtette és a sevillai csapatot négy szezonon keresztül erősítette, ahonnan 2003-ban a Zürich csapatába igazolt. Három bajnoki szezont húzott le Svájcban, ráadásul utolsó szezonjában (2005–06) svájci bajnok lett és nem is akárhogyan. Történt ugyanis, hogy az utolsó forduló előtt a FC Basel vezette a bajnoki tabellát három ponttal a Züürich előtt és ez a két csapat találkozott a zárókörben. A St. Jakob-Parkban rendezett mérkőzés 31. percében a zürichiek megszerezték a vezetést, amit a Basel Mladen Petrić révén a 73. percben kiegyenlített és amikor már úgy tűnt, hogy ez marad a végeredmény és bajnok a Basel a 93. percben Filipescu betalált Pascal Zuberbühler kapujába, amivel beállította a 2–1-es végeredményt. Ennek értelmében az FC Zürich nyerte a svájci bajnokságot, amit a Basel szurkolói nehezen viseltek és berohantak pályára, hogy megtámadják a Zürich játékosait és a játékvezetőt. Leginkább a győztes gólt szerző Filipescu volt a fő célpont, akit majdnem fejbe dobtak egy égő fáklyával.[1][2]
